Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms