Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms