Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSC2Q02487 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms