Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms