Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms