Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM3AP98173 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms