Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms