Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRX3P78415 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms