Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms