Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms