Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms