Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPAP53621 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPAP53621 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPAP53621 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPAP53621 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPAP53621 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms