Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2A2P52657 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms