Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms