Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TTPAP49638 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTPAP49638 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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