Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1DP48730 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms