Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DDIT3P35638 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms