Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA10P31260 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms