Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms