Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR2AP24928 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms