Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRGP23470 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRGP23470 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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