Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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