Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FGFR4P22455 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms