Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USF1P22415 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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