Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BCKDHBP21953 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BCKDHBP21953 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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BCKDHBP21953 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BCKDHBP21953 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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