Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD247P20963 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD247P20963 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD247P20963 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms