Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGAM1P18669 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms