Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTRB1P17538 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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