Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NCK1P16333 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCK1P16333 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCK1P16333 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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