Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms