Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL2P13500 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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