Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI2P10070 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI2P10070 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLI2P10070 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms