Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HLA-DQB1P01920 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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