Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEC22BO75396 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22BO75396 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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