Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms