Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms