Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCAMP3O14828 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms