Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVV-1B6SEH8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms