Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC169A6NNP5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms