Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms