Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMD1Q9UGP4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms