Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms