Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms