Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms