Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCMF1Q9P0J7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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