Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMILIN3Q9NT22 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms