Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms