Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NIFKQ9BYG3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms