Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM5DQ9BY66 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM5DQ9BY66 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms