Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIRIP3Q9BW71 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms